Центр имеет 3 метеорологические станции, расположенные на разных природных районах Таджикистана, и предоставляют в режиме онлайн данные о климатических показателях: температуре воздуха, относительной влажности, влажности воздуха, осадках, направлении и движении ветра, температуре почвы, солнечной радиации, продолжительности солнечного сияния и т. д..

Метеостанция «Кондара»

расположена в Варзобском ущелье, в 30 км от северной части г. Душанбе, на участке Кондаре, на высоте 1215 м над уровнем моря.

Метеостанция «Дангара»

расположена в степном участке на территории Дангаринского района Хатлонской области, на высоте 710 м над уровнем моря.

Метеостанция «Джелонди»

расположена в Шугнанском районе Горно-Бадахшанской автономной области, в 125 км к востоку от города Хорог, в высокогорье, на высоте 3570 м над уровнем моря.